Учёные новосибирского центра коллективного пользования «Сибирский кольцевой источник фотонов» (СКИФ) определили пространственную структуру некоторых белков трёх вирусов, недавно обнаруженных в Китае и Японии. Их переносят клещи, у заражённых людей появляется лихорадка, снижается уровень тромбоцитов и лейкоцитов в крови, нарушается работа печени

«Разработанная программа позволила сопоставить экспериментальные данные о структуре белков этих вирусов с моделями, предсказанными нейросетями, что ускорило отбор целевых кандидатов из предсказанных структур. Полученные данные позволят лучше разобраться в жизненном цикле исследуемых вирусов и ускорят процесс разработки эффективных лекарственных препаратов и вакцин», — рассказали в пресс-службе СКИФа.

Учёные провели компьютерное моделирование для анализа траекторий движения атомов в белках вирусов и определили формы этих молекул в Шанхайском центре синхротронного излучения (SSRF). Затем при помощи нейросетей AlphaFold, RoseTTAFold и Chain-1 были предсказаны варианты структур белков, а затем эти варианты сравнили с эксперементальными данным, полученными через разработанную исследователями программу на основе малоуглового рентгеновского рассеяния (МУРР).

Знание структуры белков понадобится для понимания функционирования живых организмов, механизмов развития заболеваний, создания лекарств и вакцин.