Уголовное дело было возбуждено по материалам, полученным контрразведчиками совместно с УБЭП ГУВД по Новосибирской области. Проректор обвиняется в совершении двух противоправных действий, предусмотренных статьей УК РФ 293 «Халатность, повлекшая причинение крупного ущерба». Как стало известно порталу Сибкрай.ru, еще в 2007 году Федеральным агентством железнодорожного транспорта Минтранса РФ были выделены финансовые средства для разработки проекта здания библиотеки для СГУПСа. Чтобы определить исполнителя заказа на составление проекта библиотеки, университет провел конкурс, в котором право на заключение госконтракта выиграла некая фирма «Форма». По оперативным данным контрразведчиков, уже на этом этапе были допущены серьезные нарушения со стороны как Виктора Шелеметева, так и руководства фирмы. Получив предоплату на выполнение работ в сумме 1,8 миллионов рублей, фирма приступила к составлению проекта библиотеки. Однако, по версии следствия, «Форма» лишь «формально» выполнила заказ, нарушив целый ряд требований. По заключению эксперта Сибирского регионального центра судебной экспертизы, выполненная фирмой работа не соответствует заключенному с ней контракту, а ее стоимость завышена почти на 1,2 миллиона рублей. К примеру, не разработаны и не предъявлены заказчику все необходимые разделы: они либо отсутствуют, либо их решение не соответствует нормам. Не представлены разрешительные документы на проектирование, документы на отвод земли, кадастровый план земельного участка и т.д. Сегодня эту работу за свой счет проводит вуз. Тем не менее, Шелеметев принял проделанную «Формой» работу, перечислив в общей сложности на счета фирмы шесть миллионов рублей. Им были проигнорированы даже заключения специалистов СГУПСа о неполноте и плохом качестве проекта.